В стране довольно немного природоохранных зон, но зато каждая из них поистине уникальна. Национальные парки Тикаль, Рио-Дульче, Киригуа и Атитлан не только занимаются охраной природных комплексов, но и хранят на своей территории огромное количество исторических памятников, оставшихся от древних культур доколумбовой Америки. Создаваемый при поддержке международного сообщества Экологический парк рифов Саподилья обещает стать одним из лучших морских заповедников западного полушария. Заповедник Челема поддерживает выживание национального символа страны - птицы кетцаль.
Почти вся территория Гватемалы лежит в зоне средневысоких и высоких горных хребтов системы Кордильеры (более половины территории страны занимают горы), которые двумя ветвями - Кучуматанес и Сьерра-Мадре, тянутся с севера на юг. Западная часть страны находится в зоне активного вулканизма - здесь расположено 33 вулкана, многие из которых активны и достигают высоты 3800 м. Самой высокой точкой страны считается вулкан Тахумулько (4 211 м).
