Внутреннее автобусное сообщение отлично развито, и добраться на автобусе можно практически до любой точки страны. Проблемой иного рода является отсутствие четких расписаний и исключительно устаревший автобусный парк. Подавляющее большинство сальвадорских автобусов - старые желтые американские школьные автобусы, давно отжившие свой век. Вместе с тем, между крупными городами курсируют современные автобусы, оснащенные кондиционерами и удобными сидениями. Проезд на них примерно вдвое дороже, чем на обычных автобусах.
Городской транспорт представлен старыми американскими школьными автобусами желтого цвета и более новыми бразильскими, имеющими свои номера и указание направления на лобовом стекле. Остановки по требованию в любой точке пути, как и посадка. Кроме того, в городах курсируют небольшие минибусы - маршрутные такси, а в рабочих районах - пикапы, где пассажиры садятся в кузов на деревянные скамейки. Все перечисленные виды транспорта чрезвычайно дешевы, и редко стоимость поездки даже через весь город превысит $0,30.
В настоящее время железнодорожное сообщение прекращено из-за его нерентабельности. Последний пассажирский поезд проследовал из Cан-Сальвадора в Сояпанго (Soyapango) в октябре 2005 года. Вместе с тем, линии поддерживаются в минимально приемлемом состоянии и в будущем возможно возобновление пригородного сообщения в района столичного мегаполиса.
