Внутренние авиаперевозки осуществляются компанией Egypt Air. Уровень сервиса в целом достаточно высокий, хотя на наиболее оживленных туристических маршрутах иногда случаются непредвиденные задержки.
В стране действует разветвленная сеть внутренних линий. Воздушное пассажирское сообщение осуществляется между Каиром и следующими городами: Хургада, Шарм-Эль-Шейх, аэропорт Табы (южный Синай), Александрия, Луксор, Асуан, Марса-Алам, Асьют, Абу-Симбел. Тарифы на авиаперелеты сравнительно высоки: туристы платят больше, нежели граждане Египта. Например, перелет из Каира в Луксор обойдется в $120-150 в одну сторону. В межсезонье возможны акции и распродажи авиабилетов, когда стоимость перелетов падает до 50%.