Главный аэропорт Бутана расположен в столице Паро: Paro Airport (PBH). Он приминимает как внутренние рейсы, так и международные. Национальная авиакомпания Drukair летает в Индию, Таиланд, Непал, Бангладеш, Сингапур. Также осуществляются перелеты непальской авиакомпанией Buddha Air из Катманду.
Второй по значимости аэропорт страны - Bathpalathang Airport (BUT) в Джакаре (Jakar). Также периодически рейсы принимает аэропорт Yongphulla Airport в Ташиганге (Trashigang).