Сен-Пьер и Микелон не имеют естественных очагов распространения заболеваний. Единственное неудобство представляет собой переменчивая местная погода - даже в течение летних месяцев возможны резкие понижения температуры, что при высокой влажности местного воздуха создает очень некомфортную обстановку.
Система здравоохранения на островах находится на вполне современном уровне. Небольшие, но хорошо оснащенные больницы есть в Сен-Пьере (Рю-Жорж-Лефевр) и Микелоне (Рю-Антуан-Суси), однако в случае серьезного заболевания пациенты переправляются в гораздо лучше оснащенные больницы Канады.
Настоятельно рекомендуется медицинская страховка международного образца, имеющая покрытие на случай эвакуации с территории островов воздушным путем.