Местные авиарейсы осуществляются авиакомпаний "Таджикские авиалинии" из аэропорта Душанбе в следующие города:
Худжанд (3-4 раза в день)
Хорог (2 раза в день)
Рейсы в Куляб, Гарм и Пенджикент были прекращены в 2010 году. Стоимость перелетов начинается от $70 в Худжант и до $100 в Хорог. В случае с Хорогом билеты покупаются непосредственно в день вылета, нет возможности предварительного бронирования.