Рекомендуется вакцинация против туберкулеза, гепатита В, японского энцефалита, столбняка и полиомиелита, а также особые методы предосторожности против филяриоза и элефантиазиса. Разносчиков малярии на островах нет, однако фиксируются нерегулярные вспышки тропической лихорадки, разносчиком которой являются случайно занесенные с других островов москиты (обитатели местных болотистых низин как правило совершенно безобидны). Поэтому рекомендуется иметь при себе средства защиты от насекомых и пользоваться различными защитными сетками.
Система здравоохранения островов Кука достаточно современная для столь отдаленного района планеты. На Раротонге действует одна крупная правительственная больница, укомплектованная специалистами, прошедшими обучение в Новой Зеландии, несколько меньшая клиника расположена на Аитутаки, остальные острова обладают сетью небольших здравпунктов. Все услуги платные.
