Климатические условия Перу достаточно необычны, поэтому при посещении страны с особым вниманием следует относиться к вопросам охраны здоровья. Большинство интересных объектов расположено в горных районах, причем на высотах, где во многих других районах мира уже просто никто не живет. Поэтому перед посещением таких высокогорных объектов следует пройти постепенную акклиматизацию на меньших высотах.
Система здравоохранения платная. Рекомендуется медицинская страховка международного образца. В большинстве крупных отелей есть врач, который оказывает первую помощь и выписывает направления в клинику. В больницах в Лиме и пригородах круглосуточно работает служба скорой помощи, в которой есть персонал, обычно вполне сносно говорящий по-английски.