Из России в Бенин нет прямых рейсов. Необходима пересадка в одной из европейских столиц. Как правило, наиболее удобные стыковки предлагаются через Париж, откуда в Котону летает как Air France, так и Afriqiyah Airways . Помимо Европы, регулярные рейсы в Бенин выполняются из Лагоса (Нигерия), Дакара (Сенегал), Уагадугу (Буркина-Фасо), Бамако (Мали), Абиджан (Кот-д'Ивуар), Аккры (Гана) и Ниамея (Нигер).