В силу небольших размеров страны, авиасообщение развито слабо. Регулярные рейсы выполняются по два раза в неделю из Бисау в Babaque (Бабаку), Gabu (Габу) и Catio (Катио). Вместе с тем, расписания часто меняются, а рейсы могут быть отменены в виду малого числа пассажиров.
Автобусное сообщение представлено, как правило, маршрутными такси (Bush taxi), 7-местными Пежо-504 и 12-местными Сandongas. Отправление по мере наполнения пассажирами. Расписание отсутствует.
В Бисау мини-автобусы стартуют от автостанции рядом с BCEAO (Banco Central dos Estados de África Ocidental) по дороге на аэропорт. Если вам нужны автобусы до городов Biombo и Prabis, то их стоит искать на автостанции на Estrada de Bor.
Цены столь невысоки, что многие туристы предпочитают и между городами перемещаться на такси.
В Гвинее-Бисау развит автобусный транспорт - как внутри городов, так и между ними.
На острова Бижагош (Bijagos) можно попасть двумя способами. Дешево, но не всегда безопасно - на каное (пирогах), которые отправляются от Porto Pidjiguiti и Porto de Bandim. Более дорогой и современный способ - яхты, которыми владеют лоджи на островах.
Автомобильный трафик на дорогах ненасыщенный. Страна считается неплохим местом для путешествий на велосипедах.