Синтоистские храмы насчитывают в этой стране около 109 млн. прихожан (синтоизм - религиозное течение, в котором насчитывается около 200 направлений). Буддистские - 96 млн. адептов. Христианские приходы - примерно 1,5 млн. человек. Около 1,1 млн. человек объединяют различные секты смешанного типа.
Большинство населения - христиане (около 60% - протестанты, 6% - католики и т. д.). Однако сильно влияние традиционных верований африканского континента, зачастую смешавшихся с христианскими нормами.
В проекте конституции страны закреплена свобода вероисповедания.
Официально жители Южного Судана исповедуют христианство (около 43% населения), традиционные анимистические верования (51%) и ислам (6%). Однако на практике местные культы настолько плотно пронизывают всю жизнь общества, что правильнее было бы говорить о полном смешении религий и конфессий.
Большая часть населения исповедует буддизм (51,2% верующих), однако в последнее время быстро растет влияние христианства - как протестантизма (34,4%), так и католицизма (10,6%). Небольшое количество верующих являются последователями шаманизма и конфуцианства (1,8%). Около 40% населения - атеисты.
В основном христиане и приверженцы местных традиционных верований. Также присутствуют индуисты, мусульмане и иудеи. В стране полная свобода вероисповедания, государство не вмешивается в дела религиозных конфессий.
5% исповедуют католицизм, не менее 30% - ислам суннитского толка, порядка 10% (преимущественно на юге страны) - местные африканские верования, и от 2 до 5% - иудаизм. Из-за отсутствия регулярной переписи населения и четких статистических данных точная информация в вопросе вероисповедания отсутствует. Кроме того, часть данных относится еще к периоду, предшествовавшему отделению Эритреи, в которой доля исповедующих ислам составляет не менее 70%.