Несмотря на небольшие размеры архипелага, на территории Тонга имеется семь природоохранных областей, включая пять национальных морских парков, один национальный исторический парк и экологический национальный парк острова Эуа. Большинство из этих заповедников охраняют экосистемы коралловых рифов и сами рифы, поскольку именно они считаются главным природным достоянием страны.
Архипелаг Тонга лежит на восточном краю желоба Тонга (протяженность около 2000 км, глубина до 10882 м), отделяющего Индо-Астралийскую и Тихоокеанскую тектонические плиты. Входящие в зону "Tихоокеанского огненного кольца", простирающегося от Новой Зеландии до Самоа, Вануату и Соломоновых островов, архипелаг Тонга по своей геологии довольно типичен для многочисленных островов Полинезии.
