Автономия имеет границы с Израилем , Иорданией (по реке Иордан) и Египтом (Сектор Газа). Западный берег представляет из себя вытянувшийся более чем на 200 километров горный кряж с высотами до 1016 метров над уровнем моря. Самая низкая точка – Мертвое море (400 м ниже уровня мирового океана - низшая точка суши на Земле).
Климат автономии соответствует израильскому, иорданскому и египетскому. Субтропический климат распространяется на всю небольшую территорию автономии, хотя из-за особенностей географического положения и рельефа встречаются участки с тропическим сухим и умеренным типом климата.
Палестинские территории состоят из двух разрозненных частей - приморского Cектора Газа и гористого Западного берега Иордана, иначае называемого Иудея и Самария.
Ситуация с природными парками стала таким же заложником арабо-израильского конфликта, как и многие другие аспекты жизни. Фактически палестинская администрация не контролирует сохранность большей части уникальных природных и исторических памятников на своей территории.
К наиболее значимым природным паркам можно отнести:
