В стране три основных перевозчика: TAME, Acianca Ecuador и LAN Ecuador. Они выполняют внутренние авиарейсы между столицей страны, Кито, и городами: Гуаякиль, Куэнка, Манта, Эсмеральдас, Пасале, Катамайо, Нуэва-Лоха и другими. Большинство внутренних рейсов субсидируются государством и поэтому тарифы достаточно низки, средняя стоимость перелета внутри страны составляет 30-50 долларов в одну сторону.
Эквадорская железная дорога вытянулась от Сан-Лоренцо на севере страны (граница с Колумбией) до Куэнки на юге, неподалеку от границы с Перу. Короткое ответвление дороги ведет в портовый Гуаякиль. Поезда следовали по этим маршрутам вплоть до 1997 года, когда страну постигло природное бедствие (ураган Эль-Ниньо) и многие километры путей были снесены бурей и оползнями в горах. С тех пор сообщение так и не восстановилось.
