Климат экваториальный и горно-экваториальный, на юге - субэкваториальный. Общая картина природно-климатических условия страны крайне неоднородная - фактически здесь можно наблюдать огромное разнообразие микроклиматических зон, связанных с особенностями местного рельефа - даже соседние участки долины могут кардинально отличаться друг от друга по погоде из-за различной топографии.
Лучшее время для посещения центральной части страны - с августа по февраль, Косты - с декабря по апрель, Ориенте же более благоприятен по своим погодным условиям в период с августа по февраль. При оценке погодных условий Эквадора следует учитывать влияние природного феномена Эль-Ниньо - мощного теплого течения, возникающего раз в несколько лет иприводящего к резким изменениям погоды в прилегающих к Тихому океану районах Эквадора и Перу.