Климатические условия страны достаточно необычны для европейца, поэтому при посещении Эквадора с особым вниманием следует относиться к вопросам охраны здоровья. Ввиду расположения большинства интересных объектов в горных районах, причем на высотах, где во многих других странах мира уже просто никто не живет, следует перед посещением таких высокогорных объектов пройти постепенную акклиматизацию на меньших высотах.
Медицинские учреждения вне главных городов чрезвычайно бедны и малочисленны. Хорошее медицинское обслуживание доступно только в Кито, Гуаякиле и в некоторых больших городах. В маленьких городах весь спектр медицинских услуг обеспечивают поликлиники, в сложных случаях пациенты переправляются на лечение в столицу и другие крупные города. Страховка международного образца, предусматривающая эвакуацию авиатранспортом в случае необходимости, настоятельно рекомендуется.