Рекомендуется профилактика против тифа, холеры, полиомиелита, гепатита B и Е, а также бешенства. Изредка в южных районах фиксируются вспышки сибирской язвы. Риск заражения малярией, исключительно в мягкой форме (P. vivax), существует с июня по сентябрь в некоторых южных и западных регионах страны, главным образом в Баткенской, Ошской и Джелал-Абадской областях, а также в районах, прилегающих к границам с Таджикистаном и Узбекистаном. Свидетельство о проверке на ВИЧ требуется для нахождения в стране сроком более одного месяца.
